Pondok Pesantren Ma’arif NU Kota Metro didirikan sejak tahun 2018 dibawah pengelolaan Lembaga Pendidikan Maarif NU Kota Metro. Pendirian Pondok Pesantren ini sebagai respon atas tuntutan masyarakat yang menghendaki penyelenggaraan pendidikan yang memadukan pendidikan pesantren dan pendidikan formal tingkat Perguruan Tinggi. Tuntutan masyarakat tersebut didasarkan adanya kekhawatiran sebagian orang tua atas semakin meningkatnya kenakalan remaja akibat pengaruh lingkungan masyarakat yang kurang kondusif. Orang tua berharap, dengan menyekolahkan anaknya di sekolah yang berada di pondok pesantren akan dapat meminimalisir berbagai kemungkinan dampak negatif lingkungan pergaulan yang kurang kondusif tersebut.
Didirikannya Pondok Pesantren ini juga tidak terlepas dengan keberadaan Institut Agama Islam Ma’arif NU (IAIMNU) Metro Lmapung yang menurut aturan pada waktu itu mensyaratkan Mahasiswanya tinggal di Asrama Pondok Pesantren. Tujuan diselenggarakan pondok pesantren yang dipadukan dengan pendidikan form Keagamaan ini untuk mewujudkan generasi muslim beriman, bertaqwa berpengetahuan luas, memiliki ketrampilan dan mandiri, sehingga siap menjalani kehidupan di era yang sesuai dengan zamannya.
Sejak dibuka pada tahun Akademik 2018/2019 sampai dengan akhir tahun pelajaran 2022/2023 penyelenggaraan pendidikan Pondok Pesantren Ma’arif NU Kota Metro dilaksanakan di gedung Pesantren Jl. Bison RT/RW 11/02 Purwosari Metro Utara Kota Metro Pondok Pesantren menempati areal tanah waqaf NU seluas 5000 M2